В давние времена здесь стоял монастырь, называвшийся «дальним», т.к. одновременно в Пскове, недалеко от Покровской башни, был еще один монастырь. Название «в бору» указывает, что в древности в окрестностях монастыря были леса. По отдалённости от города монастырь относился к пустыням. В летописи Пантелеимонов монастырь упоминается трижды: в 1341 году Псковский князь Александр Всеволодович в гневе на псковичей уехал из Пскова, псковичи же ехали за ним до Пантелеимонова  монастыря и упрашивали остаться. В 1396 году на образе Пресвятой Богородицы в Пантелеимоновом монастыре текли слёзы. В 1450 году у стен монастыря псковичи встречали владыку Евфимия. В 1581 году монастырь пострадал от расположившегося вблизи стана Батория. В 1596 году царь Феодор Иоаннович отдал монастырь Псковскому епископу Геннадию, с тех пор эта обитель считалась загородным архиерейским домом. Множество рукописных книг монастыря XIII и XIY веков были взяты в Московскую Патриаршую библиотеку. 22 июля 1763 года здесь, в загородном архиерейском доме, в возрасте 37 лет скончался Псковский епископ Гедеон Криновский (Кринов). Он заболел по дороге из Санкт-Петербурга в Псков, был вынужден остановиться и, недолго проболев, скончался. Дата строительства церкви не установлена. В конце XYIII века церковь пришла в ветхость, службы в ней не производились. Благодаря энергии и щедрости Псковского губернатора М. Б. Прутченко церковь восстановлена. Возле церкви был похоронен один из защитников Севастополя, офицер 10 артиллерийской бригады, земский начальник Псковского уезда Борис Михайлович Шатилов.  В 1905 году в бывшем монастыре была открыта школа псаломщиков. Первое постановление о закрытии церкви принято 24 августа 1923 года, 5 октября 1923 года принято окончательное постановление. Верующие ходатайствовали об открытии Пантелеймоновской церкви, однако 28 мая 1924 года их ходатайство было отклонено, а 25 июня 1924 года церковь и имущество переданы Псковскому уездному исполкому. Трест «Псковкирпич» обратился в Псковский окрисполком с ходатайством о передаче в его пользование строений бывшего Пантелеимонова монастыря. 16 марта 1930 года Псковский окрисполком принял постановление: «Помещения бывшего Пантелеймоновского монастыря в части, не занятой школой, передать в пользование кирпичного завода «Череха-Луковка». Строения монастыря сильно пострадали в ходе боевых действий во время Великой Отечественной войны. В настоящее время от былых строений сохранились колокольня и псаломщицкая школа, превращенная в жилой дом. Эти строения относятся ко второй половине XIX века, они находятся на улице Советской Армии, ближе к берегу реки Великой.