Домовая церковь Псковской гимназии освящена  6 декабря 1862 года. Престол в ней был один. Богослужения в церкви совершались законоучителем  гимназии по воскресным и праздничным  дням в учебный период. Обязанности чтецов и певцов в хоре исполняли гимназисты.

В 1917 году священником в домовой церкви был Иоанн Кюппар, с 29 июня 1917 года - протоиерей. Он родился в 1873 году в Эстонии. Служил законоучителем в Псковской мужской гимназии и в Мариинской женской гимназии, участвовал в организации епархиальной

библиотеки и читальни. Был председателем съезда законоучителей 12 - 15 июня 1913 года, состоял членом Братства святых Кирилла и Мефодия. В 1914 году награжден наперсным крестом. В 1924 году о. Иоанн проходил по делу об обновлении икон, приговорен к 1 году лишения свободы условно. Перед вторым арестом проживал в Сошихинском районе, арестован 11 февраля 1938 года, осужден «тройкой» УНКВД Ленинградской области к расстрелу. Реабилитирован 26 июля 1989 года. Церковь закрыта во исполнение декрета «Об отделении церкви от государства и школы от церкви» от 20 января (2 февраля) 1918 года. Здание гимназии сохранилось. Здесь по-прежнему находится учебное заведение - школа № 1. Церковь не восстановлена.

Адрес школы: улица Калинина, д. 5.